Cytoscape

Cytoscape
Description de l'image Cytoscape logo.svg.
Description de l'image Cytoscape network visualization1.png.
Informations
Première version
Dernière version 3.10.3 ()[1]
Dépôt github.com/cytoscape/cytoscape
Écrit en Java
Système d'exploitation MacOS, Microsoft Windows et Linux
Environnement Machine virtuelle Java
Formats lus Simple interaction file (d), Graph Modelling Language, eXtensible Graph Markup and Modeling Language (en), Systems Biology Markup Language, GraphML format (d), comma-separated values, TSV, Cytoscape Exchange Format (d), Microsoft Excel 2000-2003 Workbook (d) et Office Open XML Spreadsheet Document, Transitional, ISO/IEC 29500:2012 (d)
Formats écrits Simple interaction file (d), eXtensible Graph Markup and Modeling Language (en), GraphML format (d), PSI MI format (d) et Cytoscape Exchange Format (d)
Type Logiciel scientifique (d)
Licence Licence publique générale limitée GNU
Site web www.cytoscape.org

Cytoscape est un logiciel libre utilisé en bioinformatique pour la visualisation de réseaux d'interaction moléculaire[2]. Plus généralement, il permet l'analyse et la visualisation des réseaux complexes.

Notes et références

  1. « Cytoscape 3.10.3 Release » (consulté le )
  2. (en) Paul Shannon, Andrew Markiel, Owen Ozier, Nitin S. Baliga et al., « Cytoscape: A Software Environment for Integrated Models of Biomolecular Interaction Networks », Genome Research, vol. 13, no 11, , p. 2498–2504 (ISSN 1088-9051 et 1549-5469, PMID 14597658, DOI 10.1101/gr.1239303, lire en ligne, consulté le )

Lien externe

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