Il est revu par Charles Mutin (1927), Roethinger (1957), restauré et électrifié par Danion-Gonzalez (1971), augmenté en 1988 et 2000 par Bernard Dargassies (2000).
En 1971, la maison Danion-Gonzalez a électrifié la mécanique des claviers et des jeux, et a accru l’étendue de la pédale, la portant ainsi de 30 à 32 notes. A cette occasion, une nouvelle console prend place dans le meuble d'origine.
De plus, de nombreux ajout ont été effectués au cours des diverses interventions. Ainsi, Roethinger en 1957, Gonzalez en 1971, et Dargassies en 1988 (Octavin au Récit) et en 2000 (ajout des chamades au positif, prévues à l'origine par Cavaillé-Coll), le nombre de jeux a été porté à 60[2].
Nonobstant ces modifications, l'orgue comporte toujours 46 des 48 jeux d'origine, le rendant de fait l'un des plus remarquables témoins de la facture de Cavaillé-Coll.
Cet instrument a marqué le tournant pris par le facteur vers le style romantique et symphonique et dans l’introduction d'innovations techniques, comme le premier jeux de voix céleste au monde.
L'actuel titulaire du grand orgue de l'église de la Madeleine est François-Henri Houbart, depuis février 1979. Depuis mars 2020, il est assisté dans cette tâche par Olivier Périn[4].
Depuis 1980, le suppléant est Jean-Louis Vieille-Girardet.
Rayonnement de l'instrument
De plus, de nombreux concerts ont lieu chaque mois à la Madeleine, notamment organisés par Les Dimanches Musicaux de La Madeleine, institués en 1986 sous l'impulsion du Chanoine Marcel Thorel, alors curé de la paroisse. Ils sont organisés depuis 2009 par Olivier Périn[5].
Enregistrements
Cet orgue a permis l'enregistrement de nombreux enregistrements CD, dont beaucoup par ses titulaires[6].
Grand orgue de l'église de la Madeleine vue depuis les galeries.Ligia, LIDI 0109228-11 (2011) A Tribute to Jeanne Demessieux (Hampus Lindwall)
Priory, PRCD 772 (2002) Great European Organs # 65 (Charles Matthews)
IFO, 033 (1999) Grandes Toccates et Carillons Symphoniques
(en) Fenner Douglass, Cavaillé-Coll and the Musicians: A Documented Account of the First Thirty Years in Organ Building, Sunbury, , 1534p.: texte du marché et devis[pasclair];
Michel Louvet, «Inauguration des Grandes Orgues restaurées de la Madeleine», L’Orgue,;
Édouard Mignan, L’orgue et les organistes de la Madeleine;
Félix Raugel, Les Grandes Orgues des Églises de Paris et du département de la Seine, Paris, Fischbacher, , 278p.