Yusuke Minato fait son apparition au niveau international en 2002 à l'occasion des Championnats du monde juniors puis débute en Coupe du monde à Trondheim en novembre de la même année. Il est sélectionné pour son premier Championnat du monde en 2007 à Sapporo où il termine 40e au Gundersen. En 2009, il est médaillé d'or en compagnie de Taihei Kato, Akito Watabe et Norihito Kobayashi lors du concours par équipes. Il participe aux Jeux olympiques en 2010 et 2014 où il finit cinquième par équipes.